O SGGQ do IPB está estruturado em macroprocessos nucleares e macroprocessos de suporte.
Os macroprocessos nucleares – ensino/aprendizagem, investigação, internacionalização e identidade & comunidade - representam os domínios/áreas de atuação essenciais à concretização da missão e estratégia da instituição.
Ensino/Aprendizagem - o macroprocesso nuclear ensino/aprendizagem inclui todos os processos e procedimentos associados ao ambiente de ensino e aprendizagem e ao ciclo de vida dos projetos educativos.
Investigação - o macroprocesso nuclear investigação inclui todos os processos e procedimentos associados à promoção, valorização e avaliação das atividades de investigação e desenvolvimento, inovação e transferência de conhecimento.
Internacionalização - o macroprocesso nuclear internacionalização inclui todos os processos e procedimentos associados à cooperação, mobilidade internacional e internacionalização do ensino e investigação.
Identidade & Comunidade - o macroprocesso nuclear identidade & comunidade inclui todos os processos e procedimentos associados à transferência de conhecimento e serviços prestados à comunidade, oferta de ações de formação/aprendizagem ao longo da vida, participação em redes de colaboração multidimensionais, dinamização cultural, desportiva e lúdica e apoio direto ao colaborador e/ou cidadão.